Chaque médicament a des effets secondaires non souhaités.
Les antibiotiques aussi quelques exemples:problèmes digestifs, vomissements, nausées, perte d'appétit, troubles du goût, réactions allergiques, coloration des dents,...
De plus certains effets secondaires sont liés à l'action antibiotique même. En effet, l'antibiotique à une action sur les bactéries que l'on désire éradiquer mais également sur toutes les bactéries qui sont sensibles à cet antibiotique précis. Donc,il y aura aussi une action sur les commensales qui se trouvent normalement sur les muqueuses de la bouche,de la gorge, des intestins, du vagin,etc..
Ainsi les bactéries les plus sensibles disparaîtront à ces endroits et seront remplacées, ou bien par des congénères plus résistants,ou par des microbes qui n'y ont rien à chercher! Les conséquences peuvent être une diarrhée, des infections par des levures au niveau de la bouche (muguet) ou au niveau du rectum chez les petits enfants, ou dans le vagin chez les femmes (Candida vaginitis).
Ces effets secondaires apparaissent souvent en cas de longs traitements avec des antibiotiques à large spectre.En effet,il s'agit d'antibiotique qui ont une action sur un grand nombre de bactéries. Ceci entraînera un profond déséquilibre de la flore naturelle et c'est la porte ouverte à la colonisation de microbes étrangers sur les muqueuses et en particulier des microbes qui sont malheureusement résistants vis-à-vis de l'antibiotique concerné.
Certains personnes sont de plus hypersensibles aux antibiotiques ce qui peut entraîner des réactions allergiques sévères.